Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaatccatggatacacttgaagtctcttgtgctcctactacaatatatctcatttctatgatgattatgtctttgttttagGGCTGCAATATGCATGGCTAAAGGAAGACTTGTCTAAAGTTGATCGCGCTGTGACACCATGGCTGGTTGCAACTATGCATCCACCTTGGTACAACAGCTA

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT4G13700.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttgtgctcctactacaatatatctcatttctatgatgattatgtctttgttttagGGCTGCAATATGCATGGCTAAAGGAAGACTTGTCTAAAGTTGATCGCGCTGTGACACCATGGCTGGTTGCAACTATGCATCCACCTTGGTACAACAGCTA
                                           tctttgtttt  CT-rich tract
               aatatatctcattt  TA-rich tract