1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgagaactctttaatctttgatatgtgcatcatctgcaatgtccaagaacttatgaaacaaatagtttattgatctgtggttgtgtgatgatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTATCACCTTGTGGTTTATCTTGGCGCCTATTGCACATCGGTGGGATCTGGG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G35360.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394635|gb|EG437227.1|EG437227
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394647|gb|EG437239.1|EG437239
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: CGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACCTTTCTCTTTTTGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394640|gb|EG437232.1|EG437232
genomic: CGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394655|gb|EG437247.1|EG437247
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394641|gb|EG437233.1|EG437233
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|164046461|gb|ES080841.1|ES080841
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: AGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394653|gb|EG437245.1|EG437245
genomic: AGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: CGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394642|gb|EG437234.1|EG437234
genomic: CGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: TGGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394656|gb|EG437248.1|EG437248
genomic: T-GGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: TATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394643|gb|EG437235.1|EG437235
genomic: TATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394651|gb|EG437243.1|EG437243
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: TGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394644|gb|EG437236.1|EG437236
genomic: TGGAAGAGGAAGTTATACTAC-TTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: AACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394645|gb|EG437237.1|EG437237
genomic: AACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTAEST: gi|116394636|gb|EG437228.1|EG437228
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
EST: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAG ATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
genomic: GTGGAAGAGGAAGTTATACTACTTTCTGCGTAACAAGTTGAAGCTGCCAGgtgagaactc ... gatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTA
aagaacttatgaaacaaatagtttattgatctgtggttgtgtgatgatcttctagATATCATTCTTATGGGACTTTTCTCTTTAAGTCTAAAGATGTGGGTTATTATCACCTTGTGGTTTATCTTGGCGCCTATTGCACATCGGTGGGATCTGGG
tattgat putative branch site (score: 3)
tcttct putative PPT
ttatgaaacaaatagt TA-rich tract