1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' |
gtgagtttcgattctttgatttcttgttctatagtttcttgaagtatttggttactttcttgttggtaaatatgcctgctttctgcatatggatttgattttgaagacaattttctttatctgtctcagATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTCCTCCACGATGGGTTCACTTCGCACATGGTTTACTTCTCTTCTTGTATCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G13560.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TAACGCTTATGGGGTTTATGTTTCTAGTCACTTCCTCCCTGCTAGGCTAT ATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTCCTCCACGATGGGTTCACTTCGCAEST: gi|86070083|gb|DR365840.1|DR365840
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EST: TAACGCTTATGGGGTTTATGTTTCTAGTCACTTCCTCCCTGCTAGGCTAT ATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTCCTCCACGATGGGTTCACTTCGCAEST: gi|86070082|gb|DR365839.1|DR365839
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EST: TAACGCTTATGGGGTTTATGTTTCTAGTCACTTCCTCCCTGCTAGGCTAT ATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTCCTCCACGATGGGTTCACTTCGCA
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cctgctttctgcatatggatttgattttgaagacaattttctttatctgtctcagATATATTCACCTCAGTTGGATTCTCCTCCTCCACGATGGGTTCACTTCGCACATGGTTTACTTCTCTTCTTGTATCAG
atttgat putative branch site (score: 5)
ttttctttatctgtct putative PPT
acaattttctttat TA-rich tract