1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtttggttctaattttatattcttaactccaaaggtgttgatgatgtgatatatgacattcattattgtttttaacttttcagGAGGATTTATTCATGGTCTTAATAACTTAACTTATGGAATAGATGTAGAAAAAATTAGACTCATGGGTATATTACAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G47900.5 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
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EST: AGCTTTGATTCGATCTTTGAAACTTCTATTACTTGGTCTTTTTCTCCAAG GAGGATTTATTCATGGTCTTAATAACTTAACTTATGGAATAGATGTNNNNN
genomic: AGCTTTGATTCGATCTTTGAAACTTCTATTACTTGGTCTTTTTCTCCAAGgtttggttct ... aacttttcagGAGGATTTATTCATGGTCTTAATAACTTAACTTATGGAATAGATGTAGAAA
ccaaaggtgttgatgatgtgatatatgacattcattattgtttttaacttttcagGAGGATTTATTCATGGTCTTAATAACTTAACTTATGGAATAGATGTAGAAAAAATTAGACTCATGGGTATATTACAG
ttttaac putative branch site (score: 2)
cttttc CT-rich tract
atatatgacattcatt TA-rich tract