1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgagtatgattctttataagggttctcttcttagatatgccttcagttttggttttttgatgtctcctacttggtatgcagTACAGAAAGAGTGAATTTGTTGAGAATCGAAGGTCAAACTAAGGTTGGAGGCACACTTGTGTGTGTTATGGGTGCTGTCTTCATGGTTGTATTTCGAGGT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G19185.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTCAACCATCCATNCCGGTCTTCACCTTNTCTCTTGGCTGTCATGATGGG TACAGAAAGAGTGAATTTGTTGAGAATCGAANGGT-AAACTAAGGTTGGAA
genomic: TTCAACCATCCATCCCGGTCTTCACCTT-TCTCTTGGCTGTCATGATGGGgtgagtatga ... tggtatgcagTACAGAAAGAGTGAATTTGTTGAGAATCGAA-GGTCAAACTAAGGTTGGAG
cttcttagatatgccttcagttttggttttttgatgtctcctacttggtatgcagTACAGAAAGAGTGAATTTGTTGAGAATCGAAGGTCAAACTAAGGTTGGAGGCACACTTGTGTGTGTTATGGGTGCTGTCTTCATGGTTGTATTTCGAGGT
ttttgat putative branch site (score: 4)
tctcctactt CT-rich tract
ttttttgat TA-rich tract