1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gttaggacagattcctccatctatggatctgcgctctcttttcttgttgcatttgatctttacggctttcttttcgacagGCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAACCTCACCCTTATATGTGGGGAGTTCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G35530.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAG GCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAAEST: gi|86070243|gb|DR366000.1|DR366000
genomic: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAGgttaggacag ... ttttcgacagGCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAA
EST: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAG GCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAAEST: gi|86070244|gb|DR366001.1|DR366001
genomic: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAGgttaggacag ... ttttcgacagGCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAA
EST: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAG GCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAA
genomic: CATCGGCTGTGAGTGCTGGCATGGCTACTCCAGATTGGTCTGGTTTTCAGgttaggacag ... ttttcgacagGCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAA
gatctgcgctctcttttcttgttgcatttgatctttacggctttcttttcgacagGCATATTCTCCTATGCCGCCGCCTCATGGTTATGTGGCATCTAGTCCCCAACCTCACCCTTATATGTGGGGAGTTCAG
atttgat putative branch site (score: 5)
ctttcttttc putative PPT
tttctttt TA-rich tract