1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtacaaacattataacacattatctctctttcttttttggctaagttatagtatatgattgatgaatatatccacagGAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGAATAACTTAGCTATAGGAGTGTTGCTATCGAATCAGAGCCAATATCACGA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G67150.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATTTCCTTATTACCTCCGATGAAGACGTGGCTATACTCACTTCAGCAG GAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGAEST: gi|116380402|gb|EG422994.1|EG422994
genomic: GAATTTCCTTATTACCTCCGATGAAGACGTGGCTATACTCACTTCAGCAGgtacaaacat ... atatccacagGAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGA
EST: GCTATACTCACTTCAGCAG GAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGA
genomic: GCTATACTCACTTCAGCAGgtacaaacat ... atatccacagGAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGA
tctctctttcttttttggctaagttatagtatatgattgatgaatatatccacagGAGTGCTAACAAACGGTGTGGGGCGGTCAAGCATGGTACTGAAGATGGTGAATAACTTAGCTATAGGAGTGTTGCTATCGAATCAGAGCCAATATCACGA
gattgat putative branch site (score: 4)
taagttatagtatat TA-rich tract