1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gttgaaaatattttcttgaagctctcatctatgaactccatcattgtgcttggttgtgtgtcttactgtgtttggttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCATTCATAGAGTTCACTGATGAAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G32790.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAG GTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCAEST: gi|124968785|gb|EL042719.1|EL042719
genomic: GTCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAGgttgaaaata ... gttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCA
EST: ACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAG GTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCAEST: gi|164232158|gb|EL968027.1|EL968027
genomic: ACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAGgttgaaaata ... gttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCA
EST: GTCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAG GTTGTTGACTGTCGCATAEST: gi|86051683|gb|DR347438.1|DR347438
genomic: GTCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAGgttgaaaata ... gttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATA
EST: -TCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAG GTTGTTGACTGTCGCATA
genomic: GTCACTGAAGAGCAGCTTGCTGGTTTGTTTGTGAGCTGTGGACAGgttgaaaata ... gttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATA
tatgaactccatcattgtgcttggttgtgtgtcttactgtgtttggttttaacagGTTGTTGACTGTCGCATATGCGGTGACCCAAACTCGGTCCTTCGGTTTGCATTCATAGAGTTCACTGATGAAG
gtcttac putative branch site (score: 3)
ttttaaca TA-rich tract