1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtatacatttttttcttgaattcttgttttgttagtcttaagaacgagtgaaaacagatttctagctatctgctgatttgtttgtcagagtttataatgagtttgttccattgggacttaatgttgaatccagGAGTTGATTGGTATGGGGGGTAAAACCTTTCTAGTGCCCGGAGAGTTCCCTATCGGATGCTCAGTAGTCTATTTGACATTATACAAAACATCAAACAAGG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G28600.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGAAGAGCTGGTTCCATTTGTAATCGCTTCTATTTCTTCTACAATAACG GAGTTGATTGGTATGGGGG-TAAAACCTTTCTAGTGCCCGGAGAGTTEST: gi|125086995|gb|EL146283.1|EL146283
genomic: TTGAAGAGCTGGTTCCATTTGTAATCGCTTCTATTTCTTCTACAATAACGgtatacattt ... ttgaatccagGAGTTGATTGGTATGGGGGGTAAAACCTTTCTAGTGCCCGGAGAGTT
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tgtttgtcagagtttataatgagtttgttccattgggacttaatgttgaatccagGAGTTGATTGGTATGGGGGGTAAAACCTTTCTAGTGCCCGGAGAGTTCCCTATCGGATGCTCAGTAGTCTATTTGACATTATACAAAACATCAAACAAGG
acttaat putative branch site (score: 4)
tttataatgagttt TA-rich tract