1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtcttagatcactttcatgttttgtatcataccgttgattaaaaaaatctgagtattccatgggtttaatattatatgcagAGAGACTCTGGGAATACCAAGTGTTGTAGCTGCCATGATCGGTCTCTCCATACTTCTTGTGCTAGGTGTCCTTAATTGGGACGATTGCCTAAGCGAAAAA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G64290.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGCTGTCACTCTTTGGATCTGCGG AGAGACTCTGGGAATACCAAGTGTTGTAGCTGCCATGATCGGTCTCTCCAT
genomic: TTGCTGTCACTCTTTGGATCTGCGGgtaagtctta ... ttatatgcagAGAGACTCTGGGAATACCAAGTGTTGTAGCTGCCATGATCGGTCTCTCCAT
tcataccgttgattaaaaaaatctgagtattccatgggtttaatattatatgcagAGAGACTCTGGGAATACCAAGTGTTGTAGCTGCCATGATCGGTCTCTCCATACTTCTTGTGCTAGGTGTCCTTAATTGGGACGATTGCCTAAGCGAAAAA
gtttaat putative branch site (score: 4)
ttgattaaaaaaatct TA-rich tract