1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtaaccctctcgtcctataagttctcacatatacaccccaacttgaaatcaaaatcttggcttcatcaagaacatatcaaagaacaatttttcttaaaaatgttagacttttttctatctttcagGAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTACCATTCTTCATAGTGATAACTCCTGCCGTCTGTATCATTTTTATCCCAAT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G36001.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTG GAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTACEST: gi|116421126|gb|EG463718.1|EG463718
genomic: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTGgtaaccctct ... tatctttcagGAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTAC
EST: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTG GAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTACEST: gi|116421121|gb|EG463713.1|EG463713
genomic: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTGgtaaccctct ... tatctttcagGAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTAC
EST: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTG GAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTAC
genomic: CATAAACAATACCATCCTCAAAGTCAAATGCTTCACATACGTTGATTCTGgtaaccctct ... tatctttcagGAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTAC
aacatatcaaagaacaatttttcttaaaaatgttagacttttttctatctttcagGAAACCCTTGGTTAATAACGTTAAAGATATTATGCTTATGCCTATCCGTACCATTCTTCATAGTGATAACTCCTGCCGTCTGTATCATTTTTATCCCAAT
cttttttctatctttc CT-rich tract
aatttttcttaaaaat TA-rich tract