1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgtatcgttttggtattgatgctatttttagatagttattggaattttgttatgtttggtttgttggagatatctctaaaatttgtaccttttgggcagGTTCTAATTTATTCTCCAGATGGTAGGTGTCTGTTTAAGTACCAGGCATATGAATGTGGACTTGGTGTCAAGACTGTTTCCTGGTCTCCGTGTGGTCAGT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G07590.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
ttttgttatgtttggtttgttggagatatctctaaaatttgtaccttttgggcagGTTCTAATTTATTCTCCAGATGGTAGGTGTCTGTTTAAGTACCAGGCATATGAATGTGGACTTGGTGTCAAGACTGTTTCCTGGTCTCCGTGTGGTCAGT
ctctaaa putative branch site (score: 3)
tacctttt putative PPT
atatctctaaaattt TA-rich tract