1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtacattccctctctctatctctcttttgttattaatctcttgatgattgcaaaaaaaaaattgatttttgagttttccttgttgttgtaatgaagGTATTGGAATTGGGATGTGGGAACTCTCAGTTGTGTGAAGAGTTGTATAAGGATGGGATTGTTGATATTACCTGCATTGATTTATCTTCCGTGGCGGTAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G34360.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
tgatgattgcaaaaaaaaaattgatttttgagttttccttgttgttgtaatgaagGTATTGGAATTGGGATGTGGGAACTCTCAGTTGTGTGAAGAGTTGTATAAGGATGGGATTGTTGATATTACCTGCATTGATTTATCTTCCGTGGCGGTAG
aattgat putative branch site (score: 4)
ttttccttgttgtt putative PPT
aaaaaaaaaattgatt TA-rich tract