1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtgtgtaatttatcataaacctttacataatcttgtggcatcagtttatttcaactcttttagtgaggtactcctatctttttgcttaatgttgtttgttgcttacagGTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAACAGCAACAACGCTGTGTATTGGGCAAATCGTGCATTTGCTCACACAAA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G42810.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAG GTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAEST: gi|125064723|gb|EL132247.1|EL132247
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EST: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAG GTCACAAATACTCCAGTGCTATTGEST: gi|86073689|gb|DR369446.1|DR369446
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EST: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAG GTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAEST: gi|125033817|gb|EL106086.1|EL106086
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EST: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAG GTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATEST: gi|164203938|gb|ES175004.1|ES175004
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EST: GGCCAACGAAGCTTTTAAAG GTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAEST: gi|86073688|gb|DR369445.1|DR369445
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EST: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAG GNCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAEST: gi|152035616|gb|BP859235.2|BP859235
genomic: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAGgtgtgtaatt ... ttgcttacagGTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCA
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genomic: TGTTTCACGGGCAGAGGAGTTTAAAAGTCAGGCCAACGAAGCTTTTAAAGgtgtgtaatt ... ttgcttacagGTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCA
actcttttagtgaggtactcctatctttttgcttaatgttgtttgttgcttacagGTCACAAATACTCCAGTGCTATTGATCTATATACAAAAGCTATTGAACTCAACAGCAACAACGCTGTGTATTGGGCAAATCGTGCATTTGCTCACACAAA
gcttaat putative branch site (score: 4)
tatcttttt TA-rich tract