1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgattctattttcatgagaaagttttcatctttctttttttgtggttaatgaattttggcttgttttgattttgaaagTTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGTAAAATCTCTATTCGAGCTGGTGATGGTTTTCATAACTTAAAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G18290.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAG TTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGTEST: gi|86079120|gb|DR374877.1|DR374877
genomic: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAGgtatgattct ... attttgaaagTTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGT
EST: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAG TTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGTEST: gi|19877766|gb|AU238597.1|AU238597
genomic: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAGgtatgattct ... attttgaaagTTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGT
EST: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAG TTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGT
genomic: TACAACCACATTTGATTAACATTCAATTCCAGAAGAAAGTGAAACTGCAGgtatgattct ... attttgaaagTTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGT
tttcatctttctttttttgtggttaatgaattttggcttgttttgattttgaaagTTAGTGGTTTTGTACGTTGACTTTAAGCTTGATGAGAGCTATACACCAAGTAAAATCTCTATTCGAGCTGGTGATGGTTTTCATAACTTAAAG
ttttgat putative branch site (score: 4)
ttttgattttgaaa TA-rich tract