1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagtgaactcctaatctgtagatcaaaagctttttacttcatctaagtaaggttctaatggttttatcttcttttgaatgtttcaatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAATGGCTAACTTATTGGGTCCTTTATTCATTACTTACACTCATCGAGCTC
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G74520.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052429|gb|DR348186.1|DR348186
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052441|gb|DR348198.1|DR348198
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052439|gb|DR348196.1|DR348196
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052436|gb|DR348193.1|DR348193
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052433|gb|DR348190.1|DR348190
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052431|gb|DR348188.1|DR348188
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052443|gb|DR348200.1|DR348200
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052432|gb|DR348189.1|DR348189
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|19878871|gb|AU239702.1|AU239702
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|86052438|gb|DR348195.1|DR348195
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAEST: gi|125254821|gb|EL268906.1|EL268906
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAAEST: gi|86052440|gb|DR348197.1|DR348197
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAA
EST: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCT ATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
genomic: GCCTGTGGTTAGTCTCGTTTATCCTCTgtaagtgaac ... caatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACA
tcatctaagtaaggttctaatggttttatcttcttttgaatgtttcaatggctagATATGCTTCAGTTCAAGCGATTGAAACTCAATCTCATGCTGATGACAAACAATGGCTAACTTATTGGGTCCTTTATTCATTACTTACACTCATCGAGCTC
ttctaat putative branch site (score: 2)
ttttatcttctttt TA-rich tract