1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatgtttcatgaccagtgatgatgttgattcactgattcatattctcatgtcaattataactctcttgcagGTATCCAAACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCTATATCAGCTGAATTCCCTGAGTTTAGCAACAAGGATAAGACCTTAGTCTTCCAATTCTCTGTCAA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G56340.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
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tgatgatgttgattcactgattcatattctcatgtcaattataactctcttgcagGTATCCAAACTAGCGAGGACTACAGATTCTACGCTATATCAGCTGAATTCCCTGAGTTTAGCAACAAGGATAAGACCTTAGTCTTCCAATTCTCTGTCAA
ttataac putative branch site (score: 2)
ctctcttgc CT-rich tract
tcaattataa TA-rich tract