1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtagaagaaagctttgaaaactctttaactttgatgttctttgatctcaggatttaagctaattgtgaattgtttgttatttgtgcttttaaagGTGTGTATGGTGCAGCCGAAGGCGGAAATTGATCTACAGTTTGAATCAACTAGATTAAGCACTCCTTGGGGATATGTTAGTGCAATTGCTTTATGTGTTA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G17870.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
tttgatctcaggatttaagctaattgtgaattgtttgttatttgtgcttttaaagGTGTGTATGGTGCAGCCGAAGGCGGAAATTGATCTACAGTTTGAATCAACTAGATTAAGCACTCCTTGGGGATATGTTAGTGCAATTGCTTTATGTGTTA
agctaat putative branch site (score: 3)
tgctttt putative PPT
aattgtttgttattt TA-rich tract