1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtatgaaatattcatctgactttagttatgatgtttgagtatgtgtgatcttcagtctgatgacagtttggttatgttattttgcagCCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTTGGGAAGTCTCCATACATCAACTGCTTACCGTCTCTCTACCACCACAGATTAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G07630.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGGCTCCTTAAAGGTCACAAGAGCGTTTGGTGCTGGTTTCCTTAAGCAG CCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTTGGGEST: gi|124825736|gb|EH910602.1|EH910602
genomic: AAGGCTCCTTAAAGGTCACAAGAGCGTTTGGTGCTGGTTTCCTTAAGCAGgtatgaaata ... tattttgcagCCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTTGGG
EST: AAGGCTCCTTAAAGGTCACAAGAGCGTTTGGTGCTGGTTTCCTTAAGCAG CCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTT
genomic: AAGGCTCCTTAAAGGTCACAAGAGCGTTTGGTGCTGGTTTCCTTAAGCAGgtatgaaata ... tattttgcagCCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTT
gtttgagtatgtgtgatcttcagtctgatgacagtttggttatgttattttgcagCCTAAATGGAACAATGCACTTCTTGAGATGTTCCAAATTGATTACGTTGGGAAGTCTCCATACATCAACTGCTTACCGTCTCTCTACCACCACAGATTAG
gtctgat putative branch site (score: 4)
ttatttt putative PPT
ttatgttatttt TA-rich tract