1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
gtaagatttgttggctcccttcgttttggtttagtactctctctttctctctcaacgggttattcactcttgaaccttttggatgaattttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATTATCCATTTCTACAACCTAGCCAACCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G78900.1 |
intron # | 18 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116484152|gb|EG526744.1|EG526744
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|124822727|gb|EH907593.1|EH907593
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: CTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116484817|gb|EG527409.1|EG527409
genomic: CTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116423655|gb|EG466247.1|EG466247
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116423878|gb|EG466470.1|EG466470
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116423877|gb|EG466469.1|EG466469
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116467266|gb|EG509858.1|EG509858
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116484141|gb|EG526733.1|EG526733
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTCGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116452176|gb|EG494768.1|EG494768
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTT-GCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTTTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116463788|gb|EG506380.1|EG506380
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|125031712|gb|EL103981.1|EL103981
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: TTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|164136381|gb|ES111995.1|ES111995
genomic: TTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: TGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116436722|gb|EG479314.1|EG479314
genomic: TGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116424281|gb|EG466873.1|EG466873
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116452175|gb|EG494767.1|EG494767
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116456041|gb|EG498633.1|EG498633
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116433583|gb|EG476175.1|EG476175
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116423654|gb|EG466246.1|EG466246
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116451304|gb|EG493896.1|EG493896
genomic: AGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116424219|gb|EG466811.1|EG466811
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATEST: gi|116468179|gb|EG510771.1|EG510771
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
EST: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACC ATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
genomic: ACAGCTAAGCTATTGAGGGAAGATTACCTTGCTCAAAACGCGTTTACACCgtaagatttg ... tttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACAT
tttctctctcaacgggttattcactcttgaaccttttggatgaattttttgacagATATGACAAATTCTGTCCTTTCTACAAGTCCGTGTGGATGATGCGTAACATTATCCATTTCTACAACCTAGCCAACCAG
tttttt CT-rich tract
atgaatttttt TA-rich tract