1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatacgatgttctttactctggtcttgttatcatattaaaacataggaagattttgcggtctagatagagatgctaagtaacaattgaaattatgcagAGTTACATGGATGCGGAAATTAGAGGGATCATGGCACAGTACATGCCATTGGAAAGTCAACCACCCAACACAAGTGGTCACCATATGGATATATGAGTGA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G52850.1 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGGGTGTTGCAGGTCTTTCTGGATATGCAGTCTACAAATACAGAATCAGG AGTTACATGGATGCGGAAATTAGAGGGATCATGGCACAGTACATGCCATTGEST: gi|124886263|gb|EH965165.1|EH965165
genomic: TGGGTGTTGCAGGTCTTTCTGGATATGCAGTCTACAAATACAGAATCAGGgtatacgatg ... aattatgcagAGTTACATGGATGCGGAAATTAGAGGGATCATGGCACAGTACATGCCATTG
EST: TGGGTGTTGCAGGTCTTTCTGGATATGCAGTCTACAAATACAGAATCAGG AGTTACATGGATGCGGA
genomic: TGGGTGTTGCAGGTCTTTCTGGATATGCAGTCTACAAATACAGAATCAGGgtatacgatg ... aattatgcagAGTTACATGGATGCGGA
taggaagattttgcggtctagatagagatgctaagtaacaattgaaattatgcagAGTTACATGGATGCGGAAATTAGAGGGATCATGGCACAGTACATGCCATTGGAAAGTCAACCACCCAACACAAGTGGTCACCATATGGATATATGAGTGA
aagtaac putative branch site (score: 2)
taacaattgaaattat TA-rich tract