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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gttcgatctctatttcattcaatttgtcttttctggaattcaatccaaatcatgaactttggatagattgaggcaaaagtttctgtttggtaggttggattagtcaacagacaatgaaaaattgaaccttgtttcagctgatctacttgaagatttgagtaaatcttgtgtttttattgttggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATCAGCTTAGTCACAATGTGGCCAAGTTCGTTTTTGAACTCCCAACTTCTAC

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G17770.1
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86066404|gb|DR362161.1|DR362161
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066405|gb|DR362162.1|DR362162
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066415|gb|DR362172.1|DR362172
EST:     GTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCCAAGAAACGCAGA-                         -GTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: GTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCT-CCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066417|gb|DR362174.1|DR362174
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066418|gb|DR362175.1|DR362175
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066449|gb|DR362206.1|DR362206
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066416|gb|DR362173.1|DR362173
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066431|gb|DR362188.1|DR362188
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066450|gb|DR362207.1|DR362207
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGGAACGCAGAG                         TRTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066447|gb|DR362204.1|DR362204
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066445|gb|DR362202.1|DR362202
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTWCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066440|gb|DR362197.1|DR362197
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066414|gb|DR362171.1|DR362171
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066432|gb|DR362189.1|DR362189
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066435|gb|DR362192.1|DR362192
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066403|gb|DR362160.1|DR362160
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066411|gb|DR362168.1|DR362168
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066437|gb|DR362194.1|DR362194
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066408|gb|DR362165.1|DR362165
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|164084808|gb|ES064039.1|ES064039
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGAC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGT-GTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGAC
EST: gi|86066446|gb|DR362203.1|DR362203
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066421|gb|DR362178.1|DR362178
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066420|gb|DR362177.1|DR362177
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066428|gb|DR362185.1|DR362185
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066423|gb|DR362180.1|DR362180
EST:     CGTTGGTGCTGGTTCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066425|gb|DR362182.1|DR362182
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066434|gb|DR362191.1|DR362191
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|125129614|gb|EL173287.1|EL173287
EST:     GTTGGTGCTGGTGCTGCTTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGG
genomic: GTTGGTGCTGGTGCTGC-TTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGG
EST: gi|86066412|gb|DR362169.1|DR362169
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTATTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066436|gb|DR362193.1|DR362193
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066442|gb|DR362199.1|DR362199
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|125012526|gb|EL084795.1|EL084795
EST:     TTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: TTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066407|gb|DR362164.1|DR362164
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|125244228|gb|EL258313.1|EL258313
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTT
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTT
EST: gi|86066419|gb|DR362176.1|DR362176
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAATCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066448|gb|DR362205.1|DR362205
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTATTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066451|gb|DR362208.1|DR362208
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066413|gb|DR362170.1|DR362170
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066430|gb|DR362187.1|DR362187
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066422|gb|DR362179.1|DR362179
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066439|gb|DR362196.1|DR362196
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066441|gb|DR362198.1|DR362198
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066438|gb|DR362195.1|DR362195
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAAGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066444|gb|DR362201.1|DR362201
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC
EST: gi|86066429|gb|DR362186.1|DR362186
EST:     CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAG                         TGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTATTAAGAGACATC
genomic: CGTTGGTGCTGGTGCTGCTTATTTTCTTACATCCTCCAAGAAACGCAGAGgttcgatctc ... ggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gctgatctacttgaagatttgagtaaatcttgtgtttttattgttggttttatagTGTGTTTGGATCCAGAGAATTTCAAGGAGTTCAAGCTTGTTAAGAGACATCAGCTTAGTCACAATGTGGCCAAGTTCGTTTTTGAACTCCCAACTTCTAC
 agctgat  putative branch site (score: 4)
                                  tttttattgtt  TA-rich tract