Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|301501792|gb|HO207332.1|HO207332EST: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAG GATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
genomic: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAGgtatttcttg ... ttttatgcagGATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
EST:
gi|301502482|gb|HO208022.1|HO208022EST: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAG GATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
genomic: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAGgtatttcttg ... ttttatgcagGATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
EST:
gi|301501785|gb|HO207325.1|HO207325EST: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAG GATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
genomic: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAGgtatttcttg ... ttttatgcagGATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
EST:
gi|47828033|gb|CK117717.1|CK117717EST: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAG GATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
genomic: CCCCTTCTTATGGCGATCAAGGGCCAGATCTATGATGTTTCTCAGAGCAGgtatttcttg ... ttttatgcagGATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGC
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.ctacttaactcttactggtcgctaatttgcatgaccatctgttctttttatgcagGATGTTTTATGGACCAGGTGGGCCATATGCTCTGTTTGCAGGGAAAGATGCAAGCCGAGCTCTGGCAAAGATGTCATTTGAGGACCAAGACTTGACTGGA
cgctaat putative branch site (score: 3)
ccatctgttcttttt putative PPT
ttctttttat TA-rich tract