1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaaacacgttggatctcattgttctttgttttttattggttagagaaaattttcttattgagttttgatttatgcagTATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACCTGTGAAATATGTCACCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G47550.2 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAG TATGCTCACCGEST: gi|301501426|gb|HO206966.1|HO206966
genomic: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAGgtaaacacgt ... atttatgcagTATGCTCACCG
EST: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAG TATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAEST: gi|116399259|gb|EG441851.1|EG441851
genomic: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAGgtaaacacgt ... atttatgcagTATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATA
EST: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAG TATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAEST: gi|125324016|gb|EL338096.1|EL338096
genomic: ATAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAGgtaaacacgt ... atttatgcagTATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATA
EST: TAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCCTTTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAG TATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAG
genomic: TAGTACTAAGAACCTTGAAGCTCC-TTGTGCTTGTAATGGTAGTTTAAAGgtaaacacgt ... atttatgcagTATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAG
tctttgttttttattggttagagaaaattttcttattgagttttgatttatgcagTATGCTCACCGCAAGTGTGTTCAGCGTTGGTGTAATGAGAAAGGCGACATAACCTGTGAAATATGTCACCAG
ttttgat putative branch site (score: 4)
aaaattttcttattga TA-rich tract