1 5' 3' |
gtactctataaggaactctctagcttgattcttaaactctgagcaattgtctttgatcaatcaccaccttataattgataaattctctcctttatgatttttatgagaatttgtttgatcaagtgttgataatttggttttaaggattaaatattttgatctgtgatgtttttgaggatttggtctttgtttgaagTATTGATTGTTACAGATTCTATAATGTGATCCTGATTTAGGATTTTAATTCGAGATAAATGGCGACAAATGCGTGCCTTGAGTCCGATTCGCTTCTACCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G17540.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
aaggattaaatattttgatctgtgatgtttttgaggatttggtctttgtttgaagTATTGATTGTTACAGATTCTATAATGTGATCCTGATTTAGGATTTTAATTCGAGATAAATGGCGACAAATGCGTGCCTTGAGTCCGATTCGCTTCTACCT
ttttgat putative branch site (score: 4)
tctttgttt putative PPT
ttaaatattttgatct TA-rich tract