1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtttggtttttaaagttatgcgttttacttgtttgatgaaattcctcagagagcgtttgaatcagtcagaatcttatcctatagcttaatgaacgttctaagtattgatttaagcattgttgtattgcagGATTAGAGGATTGGGAACAGTGTGAAGCGAGTGAGTCCGAGAAGCTGAAAGCTACGGAAGCTATTAACAATGTGTTATCTATCTTAGTGCATTACAGCGA
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G02710.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGTGTGTCAGGATCGAGCTTTACCAGTGGAATGTGATGATGATGAACAAG GATTAGAGGATTGGGAACAEST: gi|124788482|gb|EH878161.1|EH878161
genomic: CGTGTGTCAGGATCGAGCTTTACCAGTGGAATGTGATGATGATGAACAAGgtttggtttt ... tgtattgcagGATTAGAGGATTGGGAACA
EST: CAGGATCGAGCTTTACCAGTGGAATGTGATGATGATGAACAAG GATTAGAGGATTGGGAACAGTG
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atcctatagcttaatgaacgttctaagtattgatttaagcattgttgtattgcagGATTAGAGGATTGGGAACAGTGTGAAGCGAGTGAGTCCGAGAAGCTGAAAGCTACGGAAGCTATTAACAATGTGTTATCTATCTTAGTGCATTACAGCGA
tattgat putative branch site (score: 3)
taagtattgatttaa TA-rich tract