1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaatgttattacacatcctcttttgatatatatattcttcgttttcacgatcgcttccagtttcttaattgtttacatatcattcttgtagCTATCGAGTCATGTCGGAAGGAGTTATCGGAATCTTCAGAACATGTTGGCGGCCAGTCAGAATGTTCTGAGCGGACAACTAGTGAATGCGGCGGTGCCGT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G25550.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCAAGTCTTTCAACGTGAGCTCCCTTTATGTTTAGAACTTGTAACCCAAG CTATCGAGTCATGTCGGAAGGAGTTATCGGAATCTTCAGAACATGTTGGCGEST: gi|301501629|gb|HO207169.1|HO207169
genomic: TCAAGTCTTTCAACGTGAGCTCCCTTTATGTTTAGAACTTGTAACCCAAGgtaatgttat ... attcttgtagCTATCGAGTCATGTCGGAAGGAGTTATCGGAATCTTCAGAACATGTTGGCG
EST: TCAAGTCTTTCAACGTGAGCTCCCTTTATGTTTAGAACTTGTAACCCAAG CTATCGAGTCATGTCGGAAGGAGTTATCGGAATCTTCAGAACATGTTGGCGEST: gi|116431435|gb|EG474027.1|EG474027
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cttcgttttcacgatcgcttccagtttcttaattgtttacatatcattcttgtagCTATCGAGTCATGTCGGAAGGAGTTATCGGAATCTTCAGAACATGTTGGCGGCCAGTCAGAATGTTCTGAGCGGACAACTAGTGAATGCGGCGGTGCCGT
tcttaat putative branch site (score: 3)
tcattctt putative PPT
ttaattgtttacatat TA-rich tract