1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtcaatttcactcttttcttcttttcacattttctagggttttgattgtttagcgccttagaatttgacctgaatttgagactaccttaaagtaaagatttttctcttaattcatcagAGAGCATATCAATTGTGGAGGGAGTCATTTAGAATGTATCCTTGGAATCTGGTTAAAAGAGTTAGACTTTGTTGGGACAACCTCAAACAATGGTTGACCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G06110.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATATCTCTACTCCTCTCGATCCCCATGGAGATCCTGCTCCTTCCTTCAAG AGAGCATATCAATTGTGGAGGGAGTCATTTAGAATGTATCCTTGGAATCTG
genomic: ATATCTCTACTCCTCTCGATCCCCATGGAGATCCTGCTCCTTCCTTCAAGgtcaatttca ... aattcatcagAGAGCATATCAATTGTGGAGGGAGTCATTTAGAATGTATCCTTGGAATCTG
tttgacctgaatttgagactaccttaaagtaaagatttttctcttaattcatcagAGAGCATATCAATTGTGGAGGGAGTCATTTAGAATGTATCCTTGGAATCTGGTTAAAAGAGTTAGACTTTGTTGGGACAACCTCAAACAATGGTTGACCT
tcttaat putative branch site (score: 3)
tttttctcttaattc CT-rich tract
ttaaagtaaagatttt TA-rich tract