1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GATCGTCAAAATCCAACGCAAATTGTTACAGAGATGTGTGGCTTCGTTACAATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgcatttacattcctttgacctgtaactactcatgttcataatgtcctgtcggctcgcatcacag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G018971_T01 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|33467312|gb|CF244361.1|CF244361
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|149034350|gb|EE155058.2|EE155058
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|78121963|gb|DV540347.1|DV540347
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|74246318|gb|DT654232.1|DT654232
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|86474970|gb|DY241340.1|DY241340
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATGEST: gi|71419488|gb|DR804789.1|DR804789
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGAGGEST: gi|78092523|gb|DV520897.1|DV520897
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
EST: AATCCTTTCCGGGACNNNNNNNCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATG GTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
genomic: AATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgc ... cgcatcacagGTCTCCCACCAAATTTACCAATTCGGCTTCCTAAACATGCGGATGAGGATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GATCGTCAAAATCCAACGCAAATTGTTACAGAGATGTGTGGCTTCGTTACAATCCTTTCCGGGACTTTTCTTCTTCACAAGACAAAGGATATGGTGGATGgtatgtctgcatttacattcctttgacctgtaactactcatgttcataatgtcctgtcggctcgcatcacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA