1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GATCTATCAACTGGATGGCTTTATTGTGACCCAGGTCCCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagcaattcgagcctaactcaaattctcaattggaaatggttacattccatctgttgctgttgctccaattagtttatttgtactgtacag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G062416_T04 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGAAGGTTATGATTTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|32908945|gb|CF013758.1|CF013758
genomic: AGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|32823176|gb|CD962898.1|CD962898
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|32806931|gb|CD959165.1|CD959165
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATAG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|32808151|gb|CD960385.1|CD960385
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|24773898|gb|CA409152.1|CA409152
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCTEST: gi|78074248|gb|DV502682.1|DV502682
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
EST: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGG TTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
genomic: CCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagc ... tactgtacagTTTCCATGGCGAGAAATTGCAATTATGCCCGTTCAATGGCATGCATTAGCT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GATCTATCAACTGGATGGCTTTATTGTGACCCAGGTCCCATGTTTACACCAGAAGGTTATGATCTACCGGGATGGATACCACAATGGgtaaataagcaattcgagcctaactcaaattctcaattggaaatggttacattccatctgttgctgttgctccaattagtttatttgtactgtacag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA