Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|78106173|gb|DV524591.1|DV524591EST: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAG GGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
genomic: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAGgtgtggatcc ... gcctccgcagGGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
EST:
gi|148973791|gb|EE024927.2|EE024927EST: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAG GGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
genomic: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAGgtgtggatcc ... gcctccgcagGGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
EST:
gi|60350410|gb|DN217383.1|DN217383EST: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAG GGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
genomic: TCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAGgtgtggatcc ... gcctccgcagGGGCCAACTGGTGCATTGGGTGGTAGCAGCGTGCAGGGGATGCAAGGTGGT
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
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ACTAGTCATTCTCTGCCCGGAACTGTTGGTATTGTCCAGCCAATGTCACCTCTGGCACCTGGATTGGCTTCATTGCCTGGTGGTATTTCTGCTGCCCCAGgtgtggatcctgctctggggcaggccttgacagctttgcttgccacccagcaggggggtgggctgagttttaatagcattctgggggtcggtgctaatggatcggggttgcctccgcag
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