1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
GGTTTGAAGAATGCACTTGCCTCTGGTGCCGACAAAGATGAAGAAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagtccaaaaatggatctttcttttcttatatacatatattcttgagcaatggattttactcagagtagtatgggcatgatgatttaatctaag...
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv03s0038g04270.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTGGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110399605|gb|EC966118.1|EC966118
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|34550739|gb|CF518957.1|CF518957
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110688588|gb|EE067308.1|EE067308
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAAATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|34544495|gb|CF512727.1|CF512727
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|349823637|gb|FQ415047.1|FQ415047
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTGGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|33406205|gb|CF211832.1|CF211832
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGACCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351037169|gb|FQ457002.1|FQ457002
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGEST: gi|229418802|gb|GO653039.1|GO653039
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGTAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|352794442|gb|FQ481674.1|FQ481674
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTGGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCCTTGEST: gi|37189137|gb|CF608486.1|CF608486
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|22013539|gb|BQ798573.1|BQ798573
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110717421|gb|EE093265.1|EE093265
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|22014144|gb|BQ799178.1|BQ799178
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|34547334|gb|CF515566.1|CF515566
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351022363|gb|FQ445138.1|FQ445138
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110394240|gb|EC958886.1|EC958886
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110420469|gb|EC986743.1|EC986743
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110389993|gb|EC954874.1|EC954874
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110382861|gb|EC947188.1|EC947188
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|33407293|gb|CF212920.1|CF212920
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|349823548|gb|FQ414958.1|FQ414958
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351053332|gb|FQ459200.1|FQ459200
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAACAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110384468|gb|EC948907.1|EC948907
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|34547424|gb|CF515656.1|CF515656
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110379564|gb|EC944769.1|EC944769
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351040731|gb|FQ438275.1|FQ438275
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|26262139|gb|CA813202.1|CA813202
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATTCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110420388|gb|EC986660.1|EC986660
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351014883|gb|FQ438083.1|FQ438083
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AATATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAATTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTEST: gi|351036011|gb|FQ463856.1|FQ463856
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGT
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTEST: gi|22012808|gb|BQ797842.1|BQ797842
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCT
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110406474|gb|EC972047.1|EC972047
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110369841|gb|EC934010.1|EC934010
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|352789768|gb|FQ478583.1|FQ478583
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110383518|gb|EC947896.1|EC947896
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|34546560|gb|CF514792.1|CF514792
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110732697|gb|EE108209.1|EE108209
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAAATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351025742|gb|FQ426756.1|FQ426756
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTGGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|26264214|gb|CA815277.1|CA815277
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTAGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGCGGATGCTTTEST: gi|110423800|gb|EC990151.1|EC990151
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGT-GCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTT
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|22014688|gb|BQ799722.1|BQ799722
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|28965951|gb|CB344984.1|CB344984
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110395577|gb|EC961243.1|EC961243
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|351014637|gb|FQ437639.1|FQ437639
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCGTTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110427860|gb|EC994314.1|EC994314
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110362021|gb|EC925527.1|EC925527
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTGEST: gi|110723293|gb|EE100443.1|EE100443
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
EST: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAG GTGAAGTGTGCTCAAATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
genomic: AAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagt ... ttatttccagGTGAAGTGTGCTCAGATCCTTGTTGAGGCTGGAGCAACGGTGGATGCTTTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GGTTTGAAGAATGCACTTGCCTCTGGTGCCGACAAAGATGAAGAAGATTCAGAGGGAAGGACTGCACTGCATTTCGCATGTGGGTATGGTGAGgtatgatagtccaaaaatggatctttcttttcttatatacatatattcttgagcaatggattttactcagagtagtatgggcatgatgatttaatctaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaaatg