Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CACTGGTCTTAGACCAACTCAATTCGTAGGCCAAACCCGGGGATCCAATGCTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaatttcatacatttatattacttatgatgctatgtttgtttttccagtttggtttgtctgggtgctgattgaggtttgtgttggctttttggttcccag

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv00s0181g00200.t01
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|351056372|gb|FQ454233.1|FQ454233
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349818740|gb|FQ409274.1|FQ409274
EST:     TAACCAGCTTATCAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         AGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: TAACCAGCTTA-GAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|77587051|gb|DV222661.1|DV222661
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349816312|gb|FQ399422.1|FQ399422
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349826763|gb|FQ418854.1|FQ418854
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351023558|gb|FQ432941.1|FQ432941
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349828042|gb|FQ415370.1|FQ415370
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|77582611|gb|DV220293.1|DV220293
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349832679|gb|FQ422037.1|FQ422037
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349824646|gb|FQ413313.1|FQ413313
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351044479|gb|FQ443010.1|FQ443010
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGCG-CCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCCT
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATG-GACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTT
EST: gi|349825231|gb|FQ417952.1|FQ417952
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351046506|gb|FQ453122.1|FQ453122
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351024128|gb|FQ423551.1|FQ423551
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349817096|gb|FQ399843.1|FQ399843
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349807677|gb|FQ402068.1|FQ402068
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351022541|gb|FQ447063.1|FQ447063
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351056515|gb|FQ455167.1|FQ455167
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349812686|gb|FQ409845.1|FQ409845
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351056110|gb|FQ453572.1|FQ453572
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351047413|gb|FQ451925.1|FQ451925
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351029262|gb|FQ436656.1|FQ436656
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349821594|gb|FQ411094.1|FQ411094
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351022859|gb|FQ428768.1|FQ428768
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351047064|gb|FQ454674.1|FQ454674
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349828043|gb|FQ415371.1|FQ415371
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349823653|gb|FQ415063.1|FQ415063
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349817801|gb|FQ407790.1|FQ407790
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110378547|gb|EC943684.1|EC943684
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349821882|gb|FQ413053.1|FQ413053
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351013144|gb|FQ424849.1|FQ424849
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351030972|gb|FQ439008.1|FQ439008
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110698731|gb|EE076565.1|EE076565
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351022826|gb|FQ428735.1|FQ428735
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351015123|gb|FQ444412.1|FQ444412
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|352791524|gb|FQ481103.1|FQ481103
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351017036|gb|FQ424463.1|FQ424463
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|77577352|gb|DV217388.1|DV217388
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110731923|gb|EE106757.1|EE106757
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349817494|gb|FQ407284.1|FQ407284
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351052921|gb|FQ453908.1|FQ453908
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110686442|gb|EE064082.1|EE064082
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351030176|gb|FQ432114.1|FQ432114
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349813439|gb|FQ413673.1|FQ413673
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351056212|gb|FQ453674.1|FQ453674
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351042523|gb|FQ431121.1|FQ431121
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351034019|gb|FQ447936.1|FQ447936
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349807945|gb|FQ402336.1|FQ402336
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351017793|gb|FQ436146.1|FQ436146
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351029654|gb|FQ427494.1|FQ427494
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|71869778|gb|DT018833.1|DT018833
EST:     CTAACCAGCTTAAAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349812639|gb|FQ409798.1|FQ409798
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351018380|gb|FQ439192.1|FQ439192
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351048940|gb|FQ449783.1|FQ449783
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGAACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349818577|gb|FQ403212.1|FQ403212
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351030395|gb|FQ432333.1|FQ432333
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTCCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351041068|gb|FQ443844.1|FQ443844
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110687175|gb|EE064356.1|EE064356
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351012952|gb|FQ433679.1|FQ433679
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349825201|gb|FQ417922.1|FQ417922
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110690172|gb|EE067040.1|EE067040
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|71890830|gb|DT039885.1|DT039885
EST:     CTAACCAGCTTAAAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351041232|gb|FQ444209.1|FQ444209
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|352786354|gb|FQ478963.1|FQ478963
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGCATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349810287|gb|FQ401733.1|FQ401733
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351013078|gb|FQ433805.1|FQ433805
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGTGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351041030|gb|FQ443806.1|FQ443806
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351046156|gb|FQ442534.1|FQ442534
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110726144|gb|EE101668.1|EE101668
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351015406|gb|FQ447235.1|FQ447235
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110373339|gb|EC937565.1|EC937565
EST:     CTAACCAGCTTAAAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349818974|gb|FQ411669.1|FQ411669
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351034800|gb|FQ458157.1|FQ458157
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349825524|gb|FQ419441.1|FQ419441
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349818568|gb|FQ403203.1|FQ403203
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351012707|gb|FQ430270.1|FQ430270
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|349815702|gb|FQ400858.1|FQ400858
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110685721|gb|EE062690.1|EE062690
EST:     CTAACCAGCTTAAAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|77585849|gb|DV222029.1|DV222029
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351030773|gb|FQ438611.1|FQ438611
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|110727164|gb|EE103613.1|EE103613
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
EST: gi|351041933|gb|FQ456143.1|FQ456143
EST:     CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATG                         GGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC
genomic: CTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaat ... tggttcccagGGGAACGAATTATGGTATGGACCGGACCGGGTGAAGTACTTGGGACCCTTC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CACTGGTCTTAGACCAACTCAATTCGTAGGCCAAACCCGGGGATCCAATGCTAACCAGCTTAGAGAAGTTGTTCCTATGGGAACTGGAAAATTCACTATGgtatttcaatttcatacatttatattacttatgatgctatgtttgtttttccagtttggtttgtctgggtgctgattgaggtttgtgttggctttttggttcccag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAAGT