1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
CAGGCTTATACTATGTGGACAGTGAAGGTGGCAGGGTGAAGGGCACACGTTTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacacttaaaatccagatcaaggatctgtgaacatggtggacggttattatcttgattttttttcatttgattttcttgattttgtatcttagatggccattctttgcatcaactcatttctgtacttgttgactatgtttgtttgttgctcattttttacag
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S39_347V6.1 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|7067446|gb|AW497301.1|AW497301
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: NTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTNTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCCTGCTCGTCGT-CEST: gi|7286872|gb|AW599359.1|AW599359
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|19785617|gb|BQ040349.1|BQ040349
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|67697970|gb|BJ958203.1|BJ958203
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|67727381|gb|BJ977640.1|BJ977640
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|208365548|gb|DC954789.1|DC954789
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|67693026|gb|BJ953259.1|BJ953259
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|15320288|gb|BI488085.1|BI488085
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|162182672|gb|FC360342.1|FC360342
genomic: TTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|7583925|gb|AW699826.1|AW699826
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|7148045|gb|AW509967.1|AW509967
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTATAACTGGGATATGTCTATCGACGAATCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|208395764|gb|DC924230.1|DC924230
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|67726029|gb|BJ976288.1|BJ976288
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|15320057|gb|BI487506.1|BI487506
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|208368061|gb|DC947621.1|DC947621
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|18336151|gb|BJ168173.1|BJ168173
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|208350967|gb|DC925972.1|DC925972
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|22492653|gb|BU052576.1|BU052576
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|22131737|gb|BQ826774.1|BQ826774
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTCEST: gi|208359388|gb|DC954241.1|DC954241
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
EST: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGG CTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC
genomic: TTCTCCGTTGGATCTGGCTCTACTTATGCATATGGTGTACTCGATACAGGgtaattacac ... ttttttacagCTTTAACTGGGATATGTCTATCGACGAAGCAGTAGAGCTTGCTCGTCGTTC