1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
TGAAAGTAATTGGTAAACTGCAAGATGGTACTTTATTTTTGAAAAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaactgtctctatgtttcttcccagtccccattaatttatgtttatgctaactaaggtgagtgcttgatggcttgagcag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G10730.1 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAATGGTGEST: gi|58020765|gb|CX707507.1|CX707507
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTGEST: gi|7684632|gb|AW755280.1|AW755280
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTGEST: gi|7146792|gb|AW508714.1|AW508714
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTGEST: gi|14011452|gb|BG726374.1|BG726374
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTGEST: gi|192317652|gb|FK011330.1|FK011330
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGG AGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
genomic: AAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaa ... gcttgagcagAGCAAGTAATTGATGGGCTTGACAGAGCTGTGTTGACTATGAAGAAGGGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGAAAGTAATTGGTAAACTGCAAGATGGTACTTTATTTTTGAAAAAGGGTCATGATGATGAAGGAGGGCTGTTTGAATTCAAAACTGATGAGGgtaacttgaactgtctctatgtttcttcccagtccccattaatttatgtttatgctaactaaggtgagtgcttgatggcttgagcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT