1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
CCCAGATGGAATGATCTAGATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttctgttcttgtattattattattctgtccttaatttcttttcttcttttggtggatatattagtaaggcttgtctgactggacagtttgaact...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G21910.1 |
intron # | 6 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|193329033|gb|FK293037.1|FK293037
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208063424|gb|GD866254.1|GD866254
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: GTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208258827|gb|GE054238.1|GE054238
genomic: GTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|207714240|gb|GD695019.1|GD695019
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|193660249|gb|FK603845.1|FK603845
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208251806|gb|GE045525.1|GE045525
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208315586|gb|GE114306.1|GE114306
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208334226|gb|GE130813.1|GE130813
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208292274|gb|GE095958.1|GE095958
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208183018|gb|GD981100.1|GD981100
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|14011429|gb|BG726351.1|BG726351
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208058058|gb|GD860161.1|GD860161
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: AACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTEST: gi|193696738|gb|FK637950.1|FK637950
genomic: AACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTC-TGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATT
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|208196511|gb|GD993168.1|GD993168
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|193689961|gb|FK631822.1|FK631822
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTGEST: gi|193491529|gb|FK453883.1|FK453883
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
EST: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCAEST: gi|207795266|gb|GD767775.1|GD767775
genomic: ATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCA
EST: ATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAG AGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
genomic: ATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttct ... acaactgcagAGTGCTCCACAGCCACTTTTGGAGAGCCATGAGCTGTGTGCCATGACATTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCCAGATGGAATGATCTAGATGTGAATCAGCATGTTAACAATGTGAAGTATGTTGGGTGGATTCTGGAGgtagtcttctgttcttgtattattattattctgtccttaatttcttttcttcttttggtggatatattagtaaggcttgtctgactggacagtttgaact
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ttggtgg