1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
ACGGACAGAGCGGCGATGCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagctcctattgcatgcgcattcgtctttcatttcctgaacgactgaatctttattcgaaacttcttcctacaaaaaagttatgttgaactttc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G36770.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCTTGATGAAATAGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAG GTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTGEST: gi|31471826|gb|CD413854.1|CD413854
genomic: GCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagc ... tttgaaacagGTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTG
EST: GCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAG GTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTGEST: gi|31305735|gb|CD390938.1|CD390938
genomic: GCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagc ... tttgaaacagGTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTG
EST: GCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAG GTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTGEST: gi|20449248|gb|BQ253372.1|BQ253372
genomic: GCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagc ... tttgaaacagGTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTG
EST: TGGTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTTAGGTTTAG GTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTG
genomic: TGCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagc ... tttgaaacagGTCCTGAGCATGAGTAGACTGGGTGGAGCTGGTGCTGTTGCTCAGCTTGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ACGGACAGAGCGGCGATGCTTGATGAAATTGTGGACTATGTGAAGTTCCTTAGGCTTCAGGTTAAGgtatgaaagctcctattgcatgcgcattcgtctttcatttcctgaacgactgaatctttattcgaaacttcttcctacaaaaaagttatgttgaactttc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - acaaaaaa