1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
TATGCTCTGTTATATCAGCTTCTTAAGATTTTTCTTACCCAGAGGCTGGATGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccgcttatgaatgattatcatttatcttacatatacatggttcttttatactttgttactatcaaaatgttttgatgttatgatgctcttttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G28080.2 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGGEST: gi|15203940|gb|BI426717.1|BI426717
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGGEST: gi|120529357|gb|EH257491.1|EH257491
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGGEST: gi|57574088|gb|CX547063.1|CX547063
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGGEST: gi|120529461|gb|EH257595.1|EH257595
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCCAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGGEST: gi|7326454|gb|AW620263.1|AW620263
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
EST: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATG GCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
genomic: TGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccg ... gctcttttagGCCTTGTGCATGAAGAATGCATTGCCAAAATGAGGCTGTTGTCATTGGTGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TATGCTCTGTTATATCAGCTTCTTAAGATTTTTCTTACCCAGAGGCTGGATGCATACATAGACTATCATGCTGCCAATTCCACATTGTTGAAAAGTTATGgtaagcaccgcttatgaatgattatcatttatcttacatatacatggttcttttatactttgttactatcaaaatgttttgatgttatgatgctcttttag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC