1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
TTGAGTGCTGCAGTAGGCATTGTTGGTAGGTCAGTTGAAGCTGATGTTCGAGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAGgtatgtttcttatttgtgatcatctagtatactgaaaccttaggttttgcaacagtatgcaacttgatcttttcttttgttattcaatgtaaatatttct...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G29730.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAG GTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAAGTATGGTGACTACTCGCACACEST: gi|208111187|gb|GD913595.1|GD913595
genomic: AGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAGgtatgtttct ... ctacatgcagGTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAAGTATGGTGACTACTCGCACAC
EST: CTACAGCTGCAGTAAAG GTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAAEST: gi|26048712|gb|CA785165.1|CA785165
genomic: CTACAGCTGCAGTAAAGgtatgtttct ... ctacatgcagGTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAA
EST: AGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAG GTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAAGTATGGTGACTACTCGCACAC
genomic: AGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAGgtatgtttct ... ctacatgcagGTGCATTTGTTGGATGTTCACTTGAAGGAAGTATGGTGACTACTCGCACAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTGAGTGCTGCAGTAGGCATTGTTGGTAGGTCAGTTGAAGCTGATGTTCGAGCTGGTGATGGTGGCTATGCTGCTTGTTATACCTACAGCTGCAGTAAAGgtatgtttcttatttgtgatcatctagtatactgaaaccttaggttttgcaacagtatgcaacttgatcttttcttttgttattcaatgtaaatatttct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGCAG