1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
TGTTTGGGTTGCACGTAGACCACCTGGTTATGCTTTTATTGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcagaagaattatgttgttggaatgtaatagaattaaaatcaaaattaaatgtgcatagatatgtttatttacaacattcttcttatctgctaa...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G17930.4 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|213589771|gb|DB969592.1|DB969592
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGATGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|13790205|gb|BG652796.1|BG652796
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|254321482|gb|GR824799.1|GR824799
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|192324562|gb|FK016453.1|FK016453
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298179401|gb|HO027872.1|HO027872
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|151395696|gb|EV265573.1|EV265573
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298185492|gb|HO030705.1|HO030705
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|7285723|gb|AW598210.1|AW598210
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|9983911|gb|BE658019.1|BE658019
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGGTGGAAGGGTTAAGCTTTCTCACAANNNNAGAGGTGGAGGTEST: gi|192299813|gb|FG993333.1|FG993333
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGG-AGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGT
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGATGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|192295485|gb|FG987099.1|FG987099
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|8669525|gb|BE190632.1|BE190632
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|209700148|gb|BW652992.1|BW652992
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGATGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298198145|gb|HO039684.1|HO039684
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|193434574|gb|FK401538.1|FK401538
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: ACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298164978|gb|HO011027.1|HO011027
genomic: ACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|192300160|gb|FG989282.1|FG989282
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298178379|gb|HO024114.1|HO024114
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|7591104|gb|AW706844.1|AW706844
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298179203|gb|HO027674.1|HO027674
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGATGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTGEST: gi|298165150|gb|HO011199.1|HO011199
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
EST: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATG GCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
genomic: TGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcag ... tatggagcagGCAAGAATGGTTGGAGGGTTGAGCTTTCTCACAACTCTAGAGGTGGAGGTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGTTTGGGTTGCACGTAGACCACCTGGTTATGCTTTTATTGACTTTGATGACCGCAGAGACGCACAGGATGCTATCCGTGAATTGGATGgtatgttcagaagaattatgttgttggaatgtaatagaattaaaatcaaaattaaatgtgcatagatatgtttatttacaacattcttcttatctgctaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG