1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
AGACTATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttgacattatgatttttctctttagataagtgaagcttatatgctagttcttcagttcagtgtataatattaatcttaagctgccttgaatctt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G33260.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTG TCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTTEST: gi|192308015|gb|FG998998.1|FG998998
genomic: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttga ... tatgttacagTCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTT
EST: TATATGGTTTTGCCGTATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTG TCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTTEST: gi|192306357|gb|FG995123.1|FG995123
genomic: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttga ... tatgttacagTCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTT
EST: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTG TCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTTEST: gi|192308014|gb|FG998997.1|FG998997
genomic: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttga ... tatgttacagTCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTT
EST: TATATGGTTTTGCCGTATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTG TCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTT
genomic: TATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttga ... tatgttacagTCTATGCTTGTTTTCTTCAAACCAATCAAGTTTGCGATAGCATTCACTCTT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGACTATATGGTTTTGCCATATGCTTTGCTGCTGGATTAACTTGTACGCTATTGgtaagtttgacattatgatttttctctttagataagtgaagcttatatgctagttcttcagttcagtgtataatattaatcttaagctgccttgaatctt
- - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA