1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
GTTATGGAAGATGATCAAGAAATTGCTTCATATATGTTTCGTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctttgctcccactttgattttattattgttgctatggatgtacttttatggagcttcactcaaactattaagatctttcttatttgctgttac...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G38890.1 |
intron # | 16 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATG GTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCTEST: gi|193525538|gb|FK478047.1|FK478047
genomic: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCT
EST: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATG GTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCTEST: gi|193361269|gb|FK328629.1|FK328629
genomic: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCT
EST: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATG ATTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATGTGCACAGGGACATAEST: gi|13481690|gb|BG511033.1|BG511033
genomic: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATA
EST: TAGGACTGGCCCTTCTATGCACTTATCCCCTTGAG-ATGTACNATGGATG GTTGGAGCTTGGEST: gi|207794568|gb|GD767217.1|GD767217
genomic: TAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCT-GAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGG
EST: CTGAGGATGTACGATGGATG GTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCTEST: gi|51335705|gb|CO979571.1|CO979571
genomic: CTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCT
EST: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATG GTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCTEST: gi|193653530|gb|FK599528.1|FK599528
genomic: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCATAATATGCACAGGGACATATGGACCT
EST: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATG ATTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCAT
genomic: GTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctt ... aataacctagGTTGGAGCTTGGAGAGACAGGATCAT
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTATGGAAGATGATCAAGAAATTGCTTCATATATGTTTCGTAGGACTGTCCCTTCTATGCACTTATCCCCTGAGGATGTACGATGGATGgtatgtgctttgctcccactttgattttattattgttgctatggatgtacttttatggagcttcactcaaactattaagatctttcttatttgctgttac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ctcccac