1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
CTCTCAACAGAAAACTATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaacaaattaaaacactatcaggaaataagtttgtggaataaattcaactaatccgtgtcgcaatatttcttgggcatgtgatcaggattaatg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G04910.1 |
intron # | 15 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCCEST: gi|208133389|gb|GD929096.1|GD929096
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCC
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGEST: gi|193634880|gb|FK583941.1|FK583941
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGG
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGEST: gi|21888738|gb|BQ741951.1|BQ741951
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGG
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCCEST: gi|213602382|gb|DB980445.1|DB980445
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCC
EST: TCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGGATA-TAAAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTGAAGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCCEST: gi|10236381|gb|BE805269.1|BE805269
genomic: TCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGAT-GGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCC
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAC GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCCEST: gi|209725602|gb|BW657982.1|BW657982
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCC
EST: GATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCCEST: gi|207777106|gb|GD747893.1|GD747893
genomic: GATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAGTGGTCACAATTTCC
EST: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAG GCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAG
genomic: TATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaac ... ctggttgaagGCGACAATGGCAGCATGTGGTTCTGGGATTGGAAGAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTCTCAACAGAAAACTATCATCAATGCAATGGCTGTCAATGAGGAGGGTGTGATGGTTACTGGAGgtatggaaacaaattaaaacactatcaggaaataagtttgtggaataaattcaactaatccgtgtcgcaatatttcttgggcatgtgatcaggattaatg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gaaacaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggaaataa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ggaataaa