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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TGGGCATACTAAAAACCCAGATGGGTCGGTTCAATTTATAGCAGGCAAGACTAAAGTTGGTGATGCTATTGATGGTGCAATAAAGATAATAACTGTTGCGgtatgtgctatgataaatacttgattaccagagcatgctaggtgcaattaaagatgtgtgtatccatatttatatttcagactttaatatctatgtagtgataataacccaatgaatatatag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G18180.1
intron # 13
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA15G18180.1 (Glycine max), 5'ss of exon 13
lower sequence: GRMZM5G892495_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 4
TGGGCATACTAAAAACCCAGATGGGTCGGTTCAATTTATAGCAGGCAAGACTAAAGTTGGTGATGCTATTGATGGTGCAATAAAGATAATAACTGTTGCGgtatgtgctatgataaatacttgattaccagagcatgctaggtgcaattaaagatgtgtgtatccatatttatatttcagactttaatatctatgtagtgataataacccaatgaatatatag
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AGGACATACTACAGATTCAGATGGCTCTGTTCAATTTGTTAAGAGGCACACTAGTGTGAAATCTGCAATATTTGGTTCAATAAAGATACTAACTGTTGCGgtatgta-----atggatgctt-----ttagtacattgtagacttatttt--------tttgttaaatcttatattgctgaatc----atctag-----------------------------