1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
GACTAATTTGATGAAGCTCCGTTCTGATTATAAGGATGCTTTTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttctaattactgaagtatagactagctgggttttctctttttgatatcctcatacactttttatggtctccatgttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G02530.2 |
intron # | 12 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAA GCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGATEST: gi|23732448|gb|BU764383.1|BU764383
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGAT
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAA GCTGCTGNTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGATEST: gi|15589596|gb|BI674212.1|BI674212
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGAT
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAT TCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGATEST: gi|17518632|gb|BM187674.1|BM187674
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGAT
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAA GCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGATEST: gi|7588263|gb|AW704062.1|AW704062
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGAT
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAA GCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGATEST: gi|193696238|gb|FK639260.1|FK639260
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATGCAGTCATTGAT
EST: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAA GCTGCTGTTAATGCACTCCAACNTCAGCCGATTGTCAATG
genomic: TTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttc ... tccatgttagGCTGCTGTTAATGCACTCCAACATCAGCCGATTGTCAATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GACTAATTTGATGAAGCTCCGTTCTGATTATAAGGATGCTTTTGTTGAAAAGCATGGAGTCAAATTGGGGCTTATGTCTGGCTTTGTGAAAgtatgttttctaattactgaagtatagactagctgggttttctctttttgatatcctcatacactttttatggtctccatgttag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA