1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
CTTGTTGCTGGCTTTTCTGTTTACTCACTGATGTATGAGCGTCACAAGAGCTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatcttggttatgctatgattgtgttttcgttggtactaccatatatgaaatcatgaccatgactgtctaaattgattaaattaaacaaaaatg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G38120.1 |
intron # | 10 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|22927299|gb|BU544438.1|BU544438
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|254338249|gb|GR849774.1|GR849774
genomic: CTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|254338248|gb|GR849773.1|GR849773
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|58019840|gb|CX706582.1|CX706582
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|21675163|gb|BQ627514.1|BQ627514
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTGEST: gi|192294280|gb|FG986369.1|FG986369
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
EST: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTG GTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
genomic: CTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatc ... tgtactgtagGTTTTATTATGATGTGCCCTCAATTGTTCATCAACTACAAGCTCAAATCTG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTTGTTGCTGGCTTTTCTGTTTACTCACTGATGTATGAGCGTCACAAGAGCTGGTATTCTTGGATTTTGTCTTCGCTCACAAGTTGTGTATACATGTTTGgtaagcaatcttggttatgctatgattgtgttttcgttggtactaccatatatgaaatcatgaccatgactgtctaaattgattaaattaaacaaaaatg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaacaaaa