1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
TCTTCTTCGGGTGGTTTTGACAGATAGGTCATTTTGTGCCGTGCATGGTGATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcactttttaattttcattccattttctttactttgcttttactttactgtccttctcttcgttactgcgcaaaaatcctgttcttcggattcg...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G08090.2 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTG GTACACCGGTTAGATAGGTATGCAGCAGTTGTEST: gi|120531892|gb|EH260025.1|EH260025
genomic: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcac ... gatttgctagGTACACCGGTTAGAT-GGTATGCAGCAGTTGT
EST: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTG GTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCAEST: gi|254313836|gb|GR831465.1|GR831465
genomic: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcac ... gatttgctagGTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCA
EST: CTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTG GTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCAEST: gi|209700604|gb|BW670420.1|BW670420
genomic: CTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcac ... gatttgctagGTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCA
EST: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTG GTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCAEST: gi|151411248|gb|EV281059.1|EV281059
genomic: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcac ... gatttgctagGTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCA
EST: ATGGCCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTG GTACACCGGTTAGATGATATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCA
genomic: ATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcac ... gatttgctagGTACACCGGTTAGATGGTATGCAGCAGTTGTGTAAGGTCTTTGGTTGTTCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCTTCTTCGGGTGGTTTTGACAGATAGGTCATTTTGTGCCGTGCATGGTGATGGTCTTCTCTGATTGAAATTCCACACACTGCCTCCTCTCTCCAATTTGgtaatttcactttttaattttcattccattttctttactttgcttttactttactgtccttctcttcgttactgcgcaaaaatcctgttcttcggattcg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTCCTC