1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
TGAAGATTTTGGAACATTTGAGGCACTTGGGTTGTGGTGCTGTGCTTGTTAGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAGgtttaacaatctcactcaaccatgaatttgttttttgtgttcttttccacccacgttgcatattgttttgctgtttttttttttttttttgtattttctgttgttaataattttatgtgattcttag
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G33830.1 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAG GTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGCEST: gi|192300739|gb|FG989681.1|FG989681
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EST: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAG GTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGCEST: gi|209728051|gb|BW666773.1|BW666773
genomic: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAGgtttaacaat ... tgattcttagGTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGC
EST: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAG GTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGCEST: gi|192320763|gb|FK013853.1|FK013853
genomic: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAGgtttaacaat ... tgattcttagGTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGC
EST: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAG GTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGC
genomic: AGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAGgtttaacaat ... tgattcttagGTGTATCTTTAATGGGAATGGGAAAATCTTGGAGGATTTGGTCTTGGCTGC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGAAGATTTTGGAACATTTGAGGCACTTGGGTTGTGGTGCTGTGCTTGTTAGTGGGAATGAGCTTAGGTTGGCTCTTCGTGCTGGCTTTGATCCCACGAGgtttaacaatctcactcaaccatgaatttgttttttgtgttcttttccacccacgttgcatattgttttgctgtttttttttttttttttgtattttctgttgttaataattttatgtgattcttag
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