1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TGCTTTTGGGACACAGTGATTCGTACACGAGAGACAAGAACATGCAAGTCACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTCTTGTTCAGAGAATGCCAAGgtaaattaaaaatagagtttagtttgctaaaaaggtcccttaatttttatattaattttaactaagacgctttaaattatttgggaaattggcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G67750.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTTTTGTTCAGAGAATGCCAAG ATGTAGACATGGATATTTTCATGTGGTGAATAATGATTATACACATTGGCAEST: gi|125312640|gb|EL326725.1|EL326725
genomic: ACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTCTTGTTCAGAGAATGCCAAGgtaaattaaa ... aaattggcagATGTAGACATGGATATTTTCATGTGGTGAATAATGATTATACACATTGGCA
EST: ACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTCTTGTTCAGAGAATGCCAAG ATGTAGACATGGATATTTTCATGTGGTGAATAATGATTATA
genomic: ACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTCTTGTTCAGAGAATGCCAAGgtaaattaaa ... aaattggcagATGTAGACATGGATATTTTCATGTGGTGAATAATGATTATA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCTTTTGGGACACAGTGATTCGTACACGAGAGACAAGAACATGCAAGTCACCATTGCCTTTAATCACTTTGGAGAAGGTCTTGTTCAGAGAATGCCAAGgtaaattaaaaatagagtttagtttgctaaaaaggtcccttaatttttatattaattttaactaagacgctttaaattatttgggaaattggcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA