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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacgcatctcttacattcactgtttaattagagaacaatacgtctctgaatcgtgattcagagacgtattgttcttctgtcatatgcaataagt...

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT1G08360.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86024375|gb|DR320128.1|DR320128
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024361|gb|DR320114.1|DR320114
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024382|gb|DR320135.1|DR320135
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|124965981|gb|EL040121.1|EL040121
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGG
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGG
EST: gi|86024360|gb|DR320113.1|DR320113
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|124825057|gb|EH909923.1|EH909923
EST:     ACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCG
genomic: ACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCG
EST: gi|164086979|gb|ES092788.1|ES092788
EST:     TCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: TCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024351|gb|DR320104.1|DR320104
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024395|gb|DR320148.1|DR320148
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024386|gb|DR320139.1|DR320139
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024388|gb|DR320141.1|DR320141
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|152035074|gb|BP843633.2|BP843633
EST:     TCACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGAAAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: TCACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024358|gb|DR320111.1|DR320111
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024385|gb|DR320138.1|DR320138
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
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EST: gi|86024390|gb|DR320143.1|DR320143
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024370|gb|DR320123.1|DR320123
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024398|gb|DR320151.1|DR320151
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGSCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024371|gb|DR320124.1|DR320124
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024376|gb|DR320129.1|DR320129
EST:     GATCAGATCTTAGMTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024374|gb|DR320127.1|DR320127
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024393|gb|DR320146.1|DR320146
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024352|gb|DR320105.1|DR320105
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024354|gb|DR320107.1|DR320107
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCG-T--TGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024350|gb|DR320103.1|DR320103
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024383|gb|DR320136.1|DR320136
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|116472089|gb|EG514681.1|EG514681
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024389|gb|DR320142.1|DR320142
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGTA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGG-A
EST: gi|125308638|gb|EL322723.1|EL322723
EST:     TAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTA
genomic: TAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTA
EST: gi|86024379|gb|DR320132.1|DR320132
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024387|gb|DR320140.1|DR320140
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|152034069|gb|BP866639.2|BP866639
EST:     TCACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTCCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: TCACTCAGGATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024399|gb|DR320152.1|DR320152
EST:     AGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: AGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024368|gb|DR320121.1|DR320121
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAASCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024396|gb|DR320149.1|DR320149
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024356|gb|DR320109.1|DR320109
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024381|gb|DR320134.1|DR320134
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024377|gb|DR320130.1|DR320130
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024366|gb|DR320119.1|DR320119
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024397|gb|DR320150.1|DR320150
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|124831184|gb|EH915623.1|EH915623
EST:     ATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: ATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024391|gb|DR320144.1|DR320144
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024367|gb|DR320120.1|DR320120
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024380|gb|DR320133.1|DR320133
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024355|gb|DR320108.1|DR320108
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024363|gb|DR320116.1|DR320116
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024392|gb|DR320145.1|DR320145
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024365|gb|DR320118.1|DR320118
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGASAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024372|gb|DR320125.1|DR320125
EST:     GATCAGATCTTATCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024359|gb|DR320112.1|DR320112
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024373|gb|DR320126.1|DR320126
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024353|gb|DR320106.1|DR320106
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|164120239|gb|ES080419.1|ES080419
EST:     GAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024384|gb|DR320137.1|DR320137
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAACCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
EST: gi|86024394|gb|DR320147.1|DR320147
EST:     GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAG                         TAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA
genomic: GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacg ... gttaatacagTAAGCTTCAGAGTGAGGCCGTTCGTGAAGCCATCACTACTATCACAGGGAA

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GATCAGATCTTAGCTAAATTGAGACAAGCTCAAAATGAGgtacttgacgcatctcttacattcactgtttaattagagaacaatacgtctctgaatcgtgattcagagacgtattgttcttctgtcatatgcaataagt

- - - - - - - - - - - - CAAGCT
- - - - - - - - - - - - - AGCTCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tctcttac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gagaacaa